Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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