Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms