Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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