Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms