Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms