Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms