Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms