Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms