Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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