Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms