Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Q3U6N9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Q3U6N9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Q3U6N9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Q3U6N9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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