Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U1D9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms