Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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