Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms