Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms