Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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