Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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