Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms