Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms