Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms