Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms