Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms