Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms