Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms