Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top1Q04750 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms