Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms