Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms