Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EgfrQ01279 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms