Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms