Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Mesp1P97309 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Mesp1P97309 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms