Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx1P81068 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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