Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad50P70388 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad50P70388 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad50P70388 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad50P70388 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad50P70388 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad50P70388 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad50P70388 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad50P70388 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad50P70388 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad50P70388 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad50P70388 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms