Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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SeboxP70368 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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SeboxP70368 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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SeboxP70368 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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SeboxP70368 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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SeboxP70368 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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SeboxP70368 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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