Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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