Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Arf6P62331 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms