Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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