Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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