Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms