Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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NcstnP57716 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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NcstnP57716 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms