Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Cldn18P56857 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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