Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms