Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FmodP50608 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
FmodP50608 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms