Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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