Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cxcl5P50228 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cxcl5P50228 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcl5P50228 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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