Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LmnaP48678 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms