Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VdrP48281 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VdrP48281 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms