Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms