Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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