Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VtnP29788 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VtnP29788 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VtnP29788 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VtnP29788 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VtnP29788 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VtnP29788 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VtnP29788 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VtnP29788 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VtnP29788 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VtnP29788 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VtnP29788 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VtnP29788 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VtnP29788 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VtnP29788 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VtnP29788 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VtnP29788 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VtnP29788 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms