Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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RxraP28700 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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RxraP28700 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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RxraP28700 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxraP28700 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxraP28700 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxraP28700 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxraP28700 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RxraP28700 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxraP28700 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RxraP28700 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxraP28700 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RxraP28700 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxraP28700 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RxraP28700 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RxraP28700 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxraP28700 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxraP28700 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxraP28700 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxraP28700 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxraP28700 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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RxraP28700 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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RxraP28700 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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